留抵税额大于增值税欠税怎么处理？

甲公司为增值税一般纳税人，主营涂料的生产与销售。2022年12月31日，税务师事务所在进行纳税申报代理过程中，发现下列财务会计资料：
（1）12月3日，领用自产涂料一批用于厂房翻新，已知该批涂料市场销售价格为100000元（不含增值税），账面成本为70000元。甲公司会计处理如下：
借：在建工程　　　　　　　　　113000
　贷：库存商品　　　　　　　　　100000
　　　应交税费——应交增值税（销项税额）
　　　　　　　　　　　　　　 　　13000
（2）12月10日，因仓库管理不善导致一批原材料丢失，已知该批原材料为3个月前从一般纳税人处购入，已抵扣进项税额，丢失的原材料账面成本为4000元，经提请公司办公会审核后决定由责任人张某赔偿1000元，其余作为损失予以核销。甲公司先后进行会计处理如下：
借：待处理财产损溢——待处理流动资产损溢
　　　　　　　　　　　　　　　　4000
　贷：原材料　　　　　　　　　　　4000
借：管理费用　　　　　　　　　　3000
　　其他应收款——张某　　　　　1000
　贷：待处理财产损溢——待处理流动资产损溢
　　　　　　　　　　　　　　　　　4000
（3）12月18日，通知购买甲公司自产防水材料的B公司归还包装物，B公司告知包装物已毁损，同意甲公司没收包装物押金10000元。已知该押金为本年7月份收取，甲公司会计处理如下：
借：其他应付款——B公司押金 　10000
　贷：其他业务收入　　　　　　　 10000
（4）12月20日，甲公司用自产不含税市场销售价格为180000元的涂料换取A公司（一般纳税人）自产的涂料添加剂，双方按市场销售价格互相开具了增值税专用发票，该批涂料成本为120000元。
（5）假设经过正确的账务调整和会计处理后，甲公司当月“应交税费——应交增值税”科目借方专栏（进项税额）发生额合计为358000元，贷方专栏（销项税额、进项税额转出）发生额合计为256000元。已知甲公司11月份应纳增值税额110000元尚未缴纳入库，且该部分税额已计入“应交税费——未交增值税”贷方，甲公司11月末“应交税费——应交增值税”科目余额为0。
其他相关资料：甲公司2022年12月未结账，取得合法票据的进项税额均在当月申报抵扣；涂料消费税税率为4%；涂料的最高销售价格与市场销售价格相等；不考虑城建税及附加。
要求：根据上述资料，回答下列问题。