案件基本情况：
北京市某房地产开发有限公司是于1994年9月在京注册的中外合作经营企业，合作三方分别为韩国某集团、美国某房地产公司和中国北京某农场农工商联合总公司，其中韩方占70%，美方占30%，中方以提供土地使用权为合作条件，注册资金为616万美元。该公司在中国境内主要经营综合设施的开发建设及其物业管理。
主要违法事实：
经查，该公司主要违法事实如下：
1、未办理地税税务登记。该公司于成立时曾在国税涉外分局办理过税务登记，国地税两局征管范围调整后，未到主管地方税务机关办理税务登记。
2、为执行中国财务会计制度。该公司为按中国财务、会计制度规定进行会计处理，使用韩国版本会计软件，记帐使用中文和韩文，会计凭证的使用不符合规定。
3、该公司收取某（中国）有限公司的房屋预售款共计210748620.90元，未缴纳营业税。
4、通过检查发现该公司1996年1月1日至1997年11月30日期间未履行代扣代缴中方员工个人所得税义务，应补缴个人所得税46640.80元。
5、该公司对外签订合同68份，均未帖印花税票，应补缴印花税108856.56元。
6、通过检查发现该公司在对外经济交往中取得的发票，有一些情况不符合规定，主要有：各种严禁使用的收据、出租汽车专用发票超限额使用并且该发票已过期作废、用资金往来发票列支成本费用等。
检查处理结果：
1、根据《中华人民共和国营业税暂行条例》第一条、第二条、第十五条及《中华人民共和国营业税暂行条例实施细则》第二十八条和《北京市地方税务局关于进一步明确营业税若干具体政策问题的通知》（京地税营[1994]162号文）第二条的规定，该公司预售房款金额共计210748620.90元，应补缴营业税10537431.05元。
2、根据《中华人民共和国税收征收管理法》第二十条第二款之规定，从滞纳税款之日起，按日加收滞纳税款千分之二的滞纳金，共计7806309.39元。
3、根据《中华人民共和国个人所得税法》第一条、第二条、第三条、第六条和国家税务总局关于《个人所得税代扣代缴暂行办法》第十一条之规定，应补缴个人所得税46640.80元。
4、根据《中华人民共和国印花税暂行条例》第一条的规定，应补缴印花税108856.56元。
5、根据《财政部、国家税务总局关于印花税违章处罚问题的通知》（94）财税字065号文之规定，对其处以应补贴印花税票金额五倍的罚款，计544282.80元。
6、根据《中华人民共和国发票管理办法》第二条、第二十二条、第二十五条、第三十六条和《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第三十二条、第四十八条、第四十九条之规定，对其未按规定开具发票和未按规定取得发票的行为，分别处以10000元罚款。
7、根据《中华人民共和国税收征收管理法》第三十七条、第三十九条和《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》第六十一条之规定，对其未按规定的期限办理税务登记、未按规定设置帐簿的行为，责令其限期改正；对其未按规定的期限办理纳税申报的行为，责令其限期改正，并处以2000元罚款。
以上共查补税款、滞纳金、罚款共计1906.5万元，其中：营业税1053.7万元，个人所得税4.7万元，印花税10.9万元，营业税滞纳金780.6万元，印花税罚款54.4万元，税务违法行为罚款2.2万元。
