企业应区别上月或以前月份应交未交增值税与上交当月应交增值税进行不同的会计处理。收到退回多缴的增值税，做相反的会计分录。
（1）上交增值税
①月份终了时，企业应当将当月的应交未交增值税自“应交税金―应交增值税”明细科目转入“未交增值税”明细科目，借记“应交税金―应交增值税（转出未交增值税）”科目，贷记“应交税金―未交增值税”科目。
②月份终了，企业应当将当月多缴增值税自“应交税金―应交增值税”明细科目转入“未交增值税”明细科目，借记“应交税金―未交增值税”科目，贷记“应交税金―应交增值税（转出多交增值税）”科目。
③企业当月缴纳当月应交税款时，借记“应交税金―应交增值税（已交税金）”科目，贷记“银行存款”。
④当月上交上月应交增值税，借记“应交税金―未交增值税”科目，贷记“银行存款”科目。
[例]某公司8月份上交7月份未交增值税24000元；月底上交当月应交增值税33000元，还有2000元应交增值税未缴纳。作会计分录如下：
①上交上月未交增值税时：
借：应交税金―未交增值税 24000
贷：银行存款 24000
②上交当月应交增值税时
借：应交税金―应交增值税（已交税金） 33000
贷：银行存款 33000
③将当月应交未交增值税转帐时：
借：应交税金―应交增值税（转出未交增值税） 20000
贷：应交税金―未交增值税 20000
（2）减免增值税
企业实际收到即征即退，先征后退，先征税后返还的增值税时，借记“银行存款”科目，贷记“补贴收入”科目。对于直接减免的增值税，企业应借记“应交税金―应交增值税（减免税金）”科目，贷记“补贴收入”科目。“补贴收入”科目属损益类账户，期末结转当期损益时，借记“补贴收入”科目，贷记“本年利润”科目。
[例]某公司采用先征税后返还增值税的方法，当期收到返还的增值税25000元。作如下会计分录：
①收到返还增值税款时：
借：银行存款 25000
贷：补贴收入 25000
②结转补贴收入时：
借：补贴收入 25000
贷：本年利润 25000
